《云奇飞行日记（第二部）》主要讲述云奇和一群新朋友一起在团团飞行学校发生的开心的事情和一些津津有味的故事。云奇的梦想是做环绕世界一周的旅行飞行，截止目前团团机场还没有一架飞机去过世界的各个机场，云奇决定成为团团机场第一架环游世界的飞机，但是大家都认为作为小型机的云奇在没有通过长距离和艰难航道的考试，环绕世界一周是不可能的，但是云奇认为他可以实现，云奇在为自己的环球飞行计划进行紧张的筹备，并选择在一天台风来的那天，大家无暇顾及他的时候开始进行环绕世界一周的旅行……但是，就像我们想象的那样，云奇被台风影响，陷入坠机的危机中。通过迫降，云奇终于回到了团团机场，但是从那天之后，云奇被暂停禁止飞行。环绕世界一周的计划失败了，云奇很不开心。看到云奇这个样子，团团机场的综合控制塔妮妮和团团机场的朋友们都很担心。最后团团机场的综合控制塔妮妮和云奇提了一个特别的约定——进入“团团飞行学校”能够通过最后的考试！